Процессы, связанные с кардинальным изменением исламских институтов на территории СССР, начались еще в феврале 1989 г., когда духовные лидеры и богословы Узбекистана и Таджикистана собрались на Чрезвычайное собрание мусульман и потребовали смещения председателя САДУМ муфтия Шамсуддина Бабаханова . Вскоре новым председателем САДУМ был избран директор Высшего исламского института при САДУМ Мухаммад Содик Мухаммад Юсуф .
Смещение Ш. Бабаханова, по сути дела, стало началом трансформации существующих структур духовных управлений. В 1992 г. Духовное управление мусульман Средней Азии и Казахстана, реорганизованное в Духовное управление мусульман Мавераннахра, прекратило свое существование и разделилось на республиканские муфтияты .
В марте 1989 г. процессы трансформации начались и в Духовном управлении мусульман Северного Кавказа (ДУМСК). Образованное в 1944 г. ДУМСК располагало более чем 100 мечетями, сосредоточенными преимущественно в Дагестане. Резиденция председателя ДУМСК первоначально размещалась в г. Буйнакске, потом была перенесена в Махачкалу.
В середине октября 1989 г. в Махачкале открылся съезд мусульман Северного Кавказа, призванный избрать нового председателя ДУМСК. Но основные принципы сохранения межэтнического баланса народов Северного Кавказа в этой организации не были выработаны, и поэтому судьба ДУМСК оказалась под вопросом. Как результат этих процессов через месяц на Северном Кавказе возник новый муфтият – ДУМ Кабардино Балкарской Республики во главе с Ш. Пшихачевым. В декабре 1989 г. было образовано ДУМ Чечено Ингушской Республики во главе с Ш. Газабаевым.
Последний съезд ДУМСК открылся в Махачкале 27 января 1990 г. Решением съезда оно было преобразовано в ДУМ Дагестана, что сократило зону его юрисдикции до границ этой республики. Деинтеграционные процессы коснулись и вновь созданного духовного управления. Начался раскол ДУМ Дагестана по национальному признаку, приведший к появлению по меньшей мере четырех этнических ДУМ: аварского (ДУМ Дагестана), кумыкского (Кумыкское ДУМ Дагестана), лезгинского (ДУМ Южного Дагестана) и даргинского (Даргинский казыят) .
Начало 1990 х гг. ознаменовалось новыми проблемами для мусульманских сообществ северокавказского региона – развал СССР способствовал усилению сепаратистских тенденций, особенно в Чечне.
В начале сентября 1991 г. национальные гвардейцы президента Чечни Джохара Дудаева захватили здания Верховного Совета, Совета министров, радио- и телецентра. Дж. Дудаев в своих политических целях намеревался активно использовать исламский фактор, изначально отведя ему роль главного катализатора борьбы за независимость . Еще в мае 1991 года II Общенациональный съезд чеченского народа, состоявшийся при его активном участии, своей основной задачей обозначил создание независимого исламского государства . Был создан Высший исламский совет Чеченской Республики (позже известный как Духовный центр мусульман Чеченской Республики), чему способствовало и отсутствие самостоятельного ДУМ. Только 14 октября 1991 г. Совет имамов Чеченской Республики образовал независимое ДУМ Чеченской Республики (ДУМ ЧР), муфтием которого был избран Магомед Башир Арсанукаев. В ответ на это сторонники Дудаева создали Исламский центр Чечни. В республике начался затяжной конфликт двух исламских центров, который, по сути дела, в течение 10 лет характеризовал противостояние «традиционного» ислама радикализации уммы.
Ситуация в других регионах Северного Кавказа оставалась спокойной. Автономные муфтияты были созданы в Ингушетии, Северной Осетии-Алании, Кабардино Балкарии и Адыгее. Таким образом, ни в Дагестане, ни в Чечне, ни в Карачаево Черкесии радикальным силам и сторонникам политизации ислама еще не удавалось добиться реальных результатов, однако проблема радикализации мусульманской уммы и распространения сепаратистских идей не была снята с повестки дня.
В Центральной России события в мусульманской умме развивались по другому сценарию. 16–25 августа 1989 г. в Поволжье и Приуалье прошли торжества, посвященные 1100 летию принятия ислама в Волжской Булгарии и 200 летию Духовного управления мусульман европейской части СССР и Сибири (ДУМЕС). Эти мероприятия по своему масштабу были сопоставимы с празднованием 1000 летия Крещения Руси, состоявшимся годом раньше. В нем приняли участие видные зарубежные гости, послы мусульманских стран и представители международных общественных организаций.
Достигнутые успехи были закреплены на V съезде ДУМЕС, прошедшем 6–8 июня 1990 г. в Уфе, в котором приняли участие более 700 делегатов и гостей из России, республик Союза, 36 зарубежных стран, представители международных исламских организаций – Всемирной исламской лиги, Организации Исламской конференции и Лиги арабского мира. Главным результатом съезда стало укрепление единства ДУМЕС.
В мае 1990 г. Т. Таджуддин был избран председателем Управления международных связей мусульманских организации СССР, что позволило активизировать взаимодействие с зарубежными странами. В 1991 г. он возглавил первую группу паломников, после длительного перерыва получивших возможность совершить хадж.
К началу 1991 г. в подчинение ДУМЕС входили уже сотни общин, управлять которыми становилось все сложнее. Принятая в советское время упрощенная схема властной вертикали, подчинявшая каждую общину непосредственно председателю ДУМЕС, стала давать заметные сбои. Учитывая реалии нового времени, 15 января 1991 г. президиум ДУМЕС принял решение о восстановлении территориальных образований среднего уровня – мухтасибатных округов. Решением президиума были созданы Астраханский, Бугульминский, Зеленодольский, Куйбышевский, Нижегородский, Казанский, Чистопольский, Омский, Ленинградский, Октябрьский, Сибайский, Пермский, Пензенский, Крымский, Уфимский, Свердловский, Тюменский, Московский, Саратовский, Ростовский, Челнинский, Прибалтийский, Ульяновский, Оренбургский и Стерлитамакский мухтасибаты.
5 апреля 1991 г. по инициативе Р. Гайнутдина и А. Ниязова в Москве был создан Исламский культурный центр (ИКЦ), ставший первой исламской структурой универсального характера, соединявшей в себе черты духовного центра, общественной и коммерческой организации, политической партии.
1992 год ознаменовался началом изменений в рядах до сих пор спокойного ДУМЕС. 19 августа 1992 г. имам мухтасиб Уфимского мухтасибата Н. Нигматуллин заявил о намерении создать национальный башкирский муфтият. 21 августа 1992 г. состоялся съезд, поставивший своей целью учредить независимое ДУМ Республики Башкортостан (ДУМ РБ). На съезд прибыло около 250 делегатов, представлявших 120 мусульманских общин Башкортостана . По итогам съезда было принято решение о создании ДУМ РБ и избрании Н. Нигматуллина муфтием Башкортостана.
На следующий день, 22 августа, в Набережных Челнах открылся учредительный съезд ДУМ Республики Татарстан (ДУМ РТ). На должность председателя ДУМ РТ был избран имам хатыб казанской мечети «Нурулла» Габдулла Галиуллин.
«Раскол ДУМЕСа был предрешен, тем более что на авансцену уже вышли эмиссары международных благотворительных фондов. Для всех стало ясно, что арабские спонсорские деньги лучше получать напрямую, а не через Уфу», – такую версию выдвинул известный религиозный деятель Валиулла Якупов .
Нарастающий центробежный процесс затронул и другие регионы. Свою солидарность с инициаторами раскола выразили саратовский имам мухтасиб Мукаддас Бибарсов, тюменский имам мухтасиб Галимзян Бикмуллин и ряд других лидеров ДУМЕС. Началось создание независимых духовных управлений в Поволжье и Сибири. Так, Саратовский мухтасиб М. Бибарсов создал ДУМ Саратовской, Волгоградской и Пензенской областей, известное также под названием Межрегионального ДУМ Среднего Поволжья. Г. Бикмуллин организовал ДУМ Сибири (Тюменский муфтият). К этому же времени относится и возникновение независимого ДУМ Республики Крым, которое стало формироваться сразу же после распада СССР. Власти на местах поддержали новообразованные муфтияты, создание которых вполне соответствовало интересам их национальной и религиозной политики.
30 сентября 1991 г. представители ДУМ РТ, ДУМ РБ, Межрегионального ДУМ Саратовской, Пензенской и Волгоградской областей, ДУМ Тюменской области, ДУМ Крыма и ряда других централизованных мусульманских организаций приняли решение о создании Координационного совета глав региональных духовных управлений мусульман европейской части бывшего СССР и Сибири, призванного объединить всех оппонентов ДУМЕС. Инициаторами этой встречи выступили татарстанский муфтий Г. Галиуллин и первый заместитель муфтия Башкортостана Н. Аширов.
21 октября 1992 г. в Казани прошел первый съезд Координационного совета глав региональных духовных управлений мусульман европейской части бывшего СССР и Сибири, по решению которого Совет был переименован в Высший координационный центр духовных управлений мусульман России (ВКЦДУМР), его председателем избран муфтий ДУМ РТ Г. Галиуллин, главой исполнительного комитета – Н. Аширов.
Зоной юрисдикции новой организации была объявлена вся Россия и европейские страны СНГ. В него вошли Межрегиональное ДУМ Саратовской, Пензенской и Волгоградской областей, ДУМ РБ, ДУМ РТ, ДУМ Тюменской области, ДУМ стран Балтии, Духовный центр мусульман Республики Ингушетия, ДУМ Кабардино Балкарской Республики, ДУМ Беларуси, ДУМ Республики Адыгея и Краснодарского края, ДУМ «Ассоциация мечетей» и ДУМ Оренбургской области – Бугурусланский муфтият.
8–10 ноября 1992 г. в Уфе прошел VI чрезвычайный съезд ДУМЕС, призванный остановить продолжающийся распад этой организации. По новому уставу ДУМЕС переименовывалось в Центральное духовное управление мусульман России и Европейских стран СНГ (ЦДУМ).
В январе 1994 г. в составе ЦДУМ было создано ДУМ Центрально Европейского региона России (ДУМЦЕР или Московский муфтият) с центром в Москве. Его председателем стал Р. Гайнутдин. Особый статус, приданный Московскому муфтияту, подразумевал, что это он будет исполнять функции полномочного представительства ЦДУМ в Москве, но новая структура постепенно стала самостоятельной религиозной организаций, включающей в каноническую территорию Московскую, Владимирскую, Ивановскую, Костромскую, Тульскую, Тверскую, Нижегородскую, Калужскую, Ярославскую, Калининградскую области, город Сочи Краснодарского края . Уже осенью того же года ДУМЦЕР инициировал выход из состава ЦДУМ.
Середина и вторая половина 1990-х гг. в новейшей истории исламского сообщества России стали переломными. Молодые мусульманские структуры окрепли и приспособились к жизни в новых условиях, сформировалась система исламского образования, книгоиздания и средств массовой информации, взаимоотношения с государством стали более конструктивными, чем в предыдущие периоды. Возникшая прослойка мусульман бизнесменов все более активно содействовала исламскому возрождению, позволяя духовным лидерам изыскивать источники финансирования не в арабских странах, а у себя на родине. Появились первые признаки преодоления раскола.
1 июля 1996 г. по инициативе Р. Гайнутдина в Москве прошла встреча глав созданных после 1992 г. духовных управлений: Московского муфтията, ДУМ РТ, ДУМ РБ, ДУМ Поволжья, ДУМ «Ассоциация мечетей», Бугурусланского муфтията и Регионального ДУМ Ульяновска и Ульяновской области. По итогам встречи было принято решение о создании всероссийской мусульманской структуры – Совета муфтиев России (СМР). Председателем Совета был избран Р. Гайнутдин, а руководители входящих в его состав муфтиятов стали сопредседателями .
Главной причиной создания СМР декларировалось желание консолидировать расколотое мусульманское сообщество России. Изначально Р. Гайнутдин надеялся восстановить отношения с ЦДУМ и пригласить Т. Таджуддина в ряды своих сопредседателей, однако категорический отказ председателя ЦДУМ иметь какие либо дела с лидерами новых ДУМ обусловил начало нового противостояния.
К 1997 г. Совет муфтиев значительно укрепился, приняв в свою юрисдикцию целый ряд новых централизованных структур и отдельных общин, а также наладив связи с ДУМ Дагестана, Адыгеи и Краснодарского края, Чеченской Республики. Впервые была предпринята попытка объединить духовные структуры Поволжья и Кавказа в рамках одной централизованной организации.
14 февраля 1998 г. в Казани прошел Объединительный съезд, который выполнил поставленные перед ним задачи и по итогам которого Региональное ДУМ Татарстана, находившееся в юрисдикции ЦДУМ, было присоединено к ДУМ РТ, а председателем единого муфтията стал Гусман Исхаков .
В ноябре 1998 г. в Омске прошла вторая конференция Межрегионального духовного управления мусульман Сибири и Дальнего Востока, решением которой оно было преобразовано в ДУМ Азиатской части России (ДУМАЧР).
18 января 1999 г. ДУМЦЕР прошло перерегистрацию и стало называться ДУМ Европейской части России (ДУМЕР). Смена названия привела и к изменению зоны юрисдикции – теперь Московский муфтият мог претендовать на все мусульманские общины к западу от Урала, а новый статус муфтията позволил ему активизировать работу по присоединению общин в новых регионах – Краснодарском крае, Волгоградской, Ростовской, Астраханской и Пермской областях .
В начале июня 2000 г. среди мусульманских духовных лидеров началась оживленная дискуссия, вызванная предложением главы чеченской администрации Ахмадом Кадыровым законодательно запретить ваххабизм. В развернувшейся полемике приняло активное участие ЦДУМ, обвинившее своих оппонентов в приверженности «чистому» исламу и оказанию помощи его миссионерам. В свою очередь сторонники СМР высказывались о ваххабизме крайне осторожно, явно опасаясь испортить отношения с саудовскими и кувейтскими партнерами.
Основными процессами этого периода на Кавказе стала резкая активизация сторонников радикального ислама, что привело к еще большему разделению мусульманских сообществ Дагестана и Чечни.
Расцвет ваххабизма на Северном Кавказе пришелся на 1998 год. 15 июля 1998 г. боевики полевого командира Арби Бараева атаковали казармы Гудермесского батальона национальной гвардии Чечни. Это столкновение ознаменовало начало вооруженной борьбы между радикалами и приверженцами суфизма в Чечне. К этому моменту в соседнем Дагестане ревнители «чистого» ислама установили полный контроль над тремя селами – Чабанмахи, Карамахи и Кадаром, изгнав из них всех представителей республиканской власти. 16 августа они объявили Кадарский анклав «отдельной исламской территорией», живущей по законам шариата и не подчиняющейся российским властям.
Стремительно нарастающая радикализация мусульманской общины Северного Кавказа создала мощный стимул для объединения его разрозненных муфтиятов. К 1998 г. внутримусульманская ситуация в ДУМ Дагестана, ДУМ Чеченской Республики и ДУМ Карачаево Черкесской Республики и Ставропольского края стабилизировалась, существующие расколы и межнациональные противоречия были частично преодолены, в результате чего появилась возможность уделить внимание процессу объединения. Главным инициатором объединительного процесса выступил муфтий Ингушетии М. Албогачиев, заручившийся поддержкой президента Ингушетии Руслана Аушева и ряда других влиятельных политиков. 17 августа 1998 г. на конференции северокавказских духовных управлений в Назрани было принято решение о создании Координационного центра мусульман Северного Кавказа (КЦМСК), председателем которого стал М. Албогачиев. Новая централизованная организация мусульман объявила о выходе ее членов из ВКЦДУМР и вступлении в Высший религиозный совет народов Кавказа, руководимый духовным лидером мусульман Азербайджана Аллахшукюром Паша заде. Основной текущей задачей КЦМСК декларировалось противодействие распространению ваххабизма на Северном Кавказе. За две недели до его учредительной конференции в Ингушетии совместным решением руководства республики, имамов ингушских мечетей и религиозных авторитетов это религиозное течение было законодательно запрещено .
События в Дагестане вызвали серьезную обеспокоенность у федерального центра, и в начале сентября 1998 г. и. о. министра внутренних дел РФ С. Степашин посетил селение Карамахи. В ходе своей поездки он положительно отозвался о деятельности местных джамаатов, чем вызвал недоумение у основной части мусульман. Такая позиция Москвы была расценена ими как самоустранение от проблем радикального ислама и его фактическая легализация .
В августе отряды полевых командиров Шамиля Басаева и Хаттаба пересекли границу Дагестана и захватили несколько сел Ботлихского района республики. Радикалы Кадарского анклава, к этому моменту достроившие капитальные оборонительные сооружения и закупившие достаточно оружия, выступили на их стороне. После месяца тяжелых боев боевики были выбиты с территории Дагестана, а села Кадарского анклава взяты штурмом и очищены от радикалов. Власти Дагестана совместно с мусульманскими духовными лидерами начали масштабную кампанию по искоренению в республике радикального ислама. 16 сентября 1999 г. на сессии дагестанского парламента было объявлено о запрете ваххабизма на территории Республики Дагестан, правда, без конкретного упоминания его признаков.
Осенью 1999 г. федеральные войска перенесли антитеррористическую операцию на территорию Чеченской Республики и добились значительного успеха благодаря привлечению на свою сторону большой группы боевиков. Главным союзником Москвы стал муфтий республики Ахмад Кадыров, который в первую чеченскую кампанию считался одним из самых непримиримых полевых командиров. В августе А. Кадыров вступил в открытую конфронтацию с наиболее влиятельными полевыми командирами, резко осудив рейд Басаева и Хаттаба в Дагестан.
Лояльность А. Кадырова к федеральной власти и его авторитет в республике как духовного деятеля вскоре сделали его признанным лидером чеченцев. Конструктивная политика Кадырова была по достоинству оценена, и 8 июня 2000 г. он был назначен главой временной администрации Чечни, сохранив полномочия муфтия. Вскоре он приступил к процедуре передачи духовной власти, и 22 августа был созван съезд ДУМ Чеченской Республики, на котором новым муфтием Чечни был избран имам Шатойского района Ахмад Шамаев.
В феврале 2001 г. в Москве было открыто официальное представительство КЦМСК. Лидеры центра официально заявили, что являются самостоятельной структурой, это привело к созданию третьего центра, помимо ЦДУМ и СМР. В декабре 2001 г. КЦМСК был принят в Межрелигиозный совет России, а летом 2002 г. его председатель М. Албогачиев вошел в Совет по взаимодействию с религиозными организациями при Президенте России.
В начале 2003 г. самой волнующей темой для российских мусульман стала ситуация вокруг Ирака. Планы США и их союзников по свержению режима Саддама Хуссейна были единодушно осуждены всеми мусульманскими центрами, которые заявляли о своей солидарности с иракским народом. На фоне волны антизападных настроений особую активность проявило ЦДУМ, предложившее направить в Багдад с миссией мира межрелигиозную делегацию. 17 марта 2003 г. делегация вылетела в столицу Ирака.
Начало бомбардировок Ирака вызвало новый взрыв возмущения в российской умме. 3 апреля 2003 г. Т. Таджуддин, выступая на митинге в Уфе, произнес крайне эмоциональную речь, в которой объявил джихад основным членам антииракской коалиции – США и Великобритании. Именно поэтому российская власть отнеслась к объявлению джихада крайне серьезно, поскольку исход войны выглядел очевидным и теперь было целесообразно, не обостряя отношения с победителями, включиться в процесс послевоенного восстановления Ирака.
Уже на следующий день прокурор Республики Башкортостан Ф. Бойков объявил Т. Таджуддину официальное предостережение о недопустимости нарушения закона «О противодействии экстремистской деятельности», поскольку «заявления о священной войне мусульман способствуют религиозной розни» , а представители Генпрокуратуры даже пригрозили приостановить деятельность ЦДУМ, если Т. Таджуддин не дезавуирует свои заявления . В данной ситуации ЦДУМ пыталось объяснять выступление Т. Таджуддина как попытку призвать мусульман к мирным формам джихада, не подразумевавшим вооруженную борьбу против стран антииракской коалиции.
Вторая половина 2003 г. запомнилась российской умме заявлением Президента РФ В. В. Путина во время его визита в Малайзию о возможности вступления России в ОИК . В своем выступлении В. В. Путин привел некоторые статистические данные о российской умме, в частности, обратил внимание, что «после многих десятилетий запретов на религиозное образование у нас сейчас действует более 100 медресе и других религиозных учебных заведений. Если в 1991 году в России было 870 мечетей, то сегодня их число уже превысило 7 тысяч» .
К середине 2010-х гг. стало очевидно, что исламское возрождение в России состоялось: мусульманские общины появились в каждом регионе России, в каждом крупном городе; количество исламских учебных заведений, внесенных в реестр Министерства юстиции на начало 2004 г., достигло 68. К 2005 г. исламское сообщество России располагало 3642 зарегистрированными общинами, которые управлялись 59 централизованными структурами. Наибольшее количество мусульманских общин действовало в Республике Татарстан (1016), Республике Дагестан (622) и Республике Башкортостан (448). При этом в Совет муфтиев России входило около 1800 общин, в КЦМСК – около 1000, и в ЦДУМ – около 800 . Мусульманская умма России окончательно осознала себя неотъемлемой частью мусульманского мира: делегации российских мусульман стали чаще выезжать в арабские страны, принимать участие в исламских конференциях и вступать в международные мусульманские организации – Организацию Исламской конференции, Европейскую исламскую конференцию, Лигу исламского мира и др. В 2002 г. при Правительстве РФ образован Совет по хаджу, в который вошли представители всех крупнейших российских муфтиятов и ряд государственных чиновников. Этот совет был уполномочен решать все связанные с хаджем вопросы и делать его проведение максимально удобным для паломников. Постепенно формировалась инфраструктура с такими необходимыми для развития мусульманского сообщества структурами, как производство халяль продукции, комитеты по вакфам и закяту, услуги по канонам шариата в банках и т. д.
Расстановка сил в исламском сообществе России после довольно долгого периода затишья стала быстро меняться в конце 2016 – начале 2017 г. Если в начале исламского возрождения основных всероссийских центров влияния в умме было всего два – ЦДУМ и СМР, то в 2001 г. к ним добавился КЦМСК. В 2011 г. была создана новая организация – Российская ассоциация исламского согласия (Всероссийский муфтият, РАИС; существовала до 2016 г.). Председателем новой организации избран глава Духовного управления мусульман Ставрополья Мухаммад Рахимов (в 2013–2016 гг. председателем был муфтий Пермского края Мухаммедгали Хузин). РАИС пыталась объединить региональные муфтияты, не вошедшие ни в одну из централизованных структур. На момент создания в РАИС входили духовные управления пяти регионов – Ставрополья, Мордовии, Рязанской области, Свердловской области и Пермского края, затем к ним присоединились муфтияты Ростовской области и Чувашии.
В 2015 г. Духовное управление мусульман Республики Крым и города Севастополя официально пополнило ряды российских муфтиятов. Крымский муфтият с его 350 общинами сотрудничает со всеми крупными мусульманскими центрами России. Его единственным оппонентом стал Таврический муфтият.
В 2016 г. было создано Духовное собрание мусульман России (ДСМР) во главе с А. Кргановым, которое с самого начала позиционировало себя как новый федеральный центр российских мусульман и закрепило свои позиции в трех крупнейших городах России – в Москве, Санкт-Петербурге и Новосибирске. Основной массив общин ДСМР сосредоточен в Чувашии, Омской области и Ханты-Мансийском АО, немало их также в Кемеровской и Томской областях. ДСМР представляет собой альянс региональных муфтиятов и отдельных общин, лидеры которых пользуются достаточно большой степенью независимости, имеет тесные связи с ДУМД, ДУМ РТ и КЦМСК, дружественен Крымскому муфтияту, однако сохраняет натянутые отношения с СМР и ЦДУМ.
Современное мусульманское сообщество России – весьма сложное и многогранное явление, в котором усматриваются внутренние богословские и идеологические различия и оттенки, что усугубляется структурным разнообразием в виде многочисленных духовных управлений. К 2020 г. в России существовало около 90 духовных управлений, входящих в ту или иную федеральную религиозную структуру, а также функционирующих самостоятельно. Помимо таких федеральных центров, как ЦДУМ, СМР, КЦМСК и ДСМР, ряд духовных управлений (ДУМ Дагестана, Чечни, хотя и входят в состав КЦМСК, Татарстана и Крыма) в своей деятельности являются вполне самостоятельными.